丹溪为滋阴学家，数百年来已成定论。然而丹溪并非唯滋阴论者，除上述外，他对气与调气之法有一定研究和成果，其论气的主导思想来源于理学和李东垣的气学观，兹论析如下：
（一）统摄天地万物和人体惟一是“气”丹溪的医学哲学思想明显导源于理学，而理学中极其重要的内容———论气，有“太虚邪气”之说，曰：“太虚无形，气之本体，其聚其散，变化之客形尔。”（《正蒙·太和篇》）又曰：“凡可状，皆有也，凡有，皆象也，凡象，皆气也。”（《正蒙·乾象篇》）认为气是充斥宇宙万物之实体，由于气的存亡聚散，而有万物之生死变化，强调人与物皆禀天地之气而生，无气则无生命万物。丹溪承理学论气之说而运用于医学，曰：“天地自相依附……大气常举之也，夫自清浊肇分，天以气运于外而摄，地以形居于中而浮于水者，是气也，即天之谓也，自天无极者观之，故曰大气。”（《格致余论·天气属金说》）他进一步又阐述：“天地以一元之气化生万物，根于中者曰神机，根于外者曰气血，万物同此一气。 ......
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