少阴包括手少阴心和足少阴肾，因此，少阴病也就是心肾疾患。
心主火，肾主水，心肾统摄人体水火阴阳之气。肾为阴阳之根，真气之所系。心火居上，肾水在下，心肾借经脉之通道，使水火上下交济，以维持人体的阴阳平衡。病至少阴，心肾功能受损，阴阳失去平衡，火衰者表现为阳虚寒证；水亏者表现为阴虚热证；若阴阳离决，精气脱竭，则可出现死证。
肾为主水之脏，少阴病阴阳失调而不能主水以行津液，又常见小便不利，水气泛滥的证候。
少阴与太阳为表里，故有邪在太阳而内及少阴的，亦有寒中少阴而仍外连太阳的表里同病。又因少阴居太阴与厥阴之间，少阴病可外合太阴见吐利，亦可内合厥阴见厥逆，故少阴有“主三阴之枢”的说法。
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